История Балатонфюреда началась еще во время присутствия римлян на территории современной Венгрии. Поскольку древние римляне с особым трепетом относились к термальным и минеральным источникам, было принято решение основать город, от которого до нашего времени сохранились некоторые руины и строения. После развала Римской империи следующее упоминание о Балатонфюреде датируется началом 13-ого столетия и связано с Тиханьским Аббатством, однако, стоит отметить, что в то время на территории современного города существовало несколько поселений, одним из которых был Фюред, существующее до сих пор и давшее название объединенному городу позже.

В начале 18-ого столетия поселения были объединены в один город, который стал быстро развиваться в курортное место благодаря мягкому средиземноморскому климату и термальным источникам минеральной воды. Вокруг источников были созданы спа-курорты, лечебницы и санатории. В настоящее время в Балатонфюреде действует лучший в Венгрии Кардиологический центр, на территории которого есть свой источник. Самыми известными «историческими» источниками Балатонфюреда являются Источник Кошута и Шекер Эрнё.

После Второй Мировой войны Балатонфюред стал известен на всем советском пространстве как молодежный лечебный курорт, и в этот период были построены многочисленные детские лагеря и типично советские санатории, в которых отдыхали представители коммунистической партии со всех стран Варшавского договора. После падения «Железного занавеса» все санатории и детские лагеря были модернизированы и превращены в комфортабельные гостиницы и хостелы для молодежи со всей Европы.